جیسا کہ ٹماٹر براؤن روگوس فروٹ وائرس دنیا بھر میں ٹماٹر اور کالی مرچ کے پودوں کو متاثر کرتا ہے ، بیج کمپنیاں مزاحم ٹماٹر کی افزائش پر کام کر رہی ہیں۔
ٹماٹر کے جینومک تسلسل کے منصوبوں کے آغاز سے پہلے ہی ٹماٹر کے افزائش کرنے والوں کے لیے امیر جینیاتی اور جینومک وسائل دستیاب تھے۔ ٹماٹر کے بڑے جراثیم کے مجموعے طویل عرصے سے کئی مقامات پر قائم ہیں۔ دنیا بھر کے جین بینکوں میں 75,000،XNUMX سے زیادہ ٹماٹر تک رسائی محفوظ ہے۔ جنیوا ، نیو یارک میں یو ایس ڈی اے جین بینک سب سے بڑا ہے۔
ٹماٹر کے جینوم کی ترتیب 2005 میں 14 ممالک کے درمیان کثیر القومی کوشش کے طور پر شروع کی گئی تھی اور 2012 میں مکمل کی گئی۔ بڑی تعداد میں جینیاتی اور فینوٹائپک ڈیٹا کا تجزیہ کرنے کے لیے مصنوعی ذہانت ، مشین لرننگ اور جدید الگورتھم کے استعمال سے ان کوششوں کو بہت تیز کیا گیا ہے۔
ٹماٹر پین جینوم۔
2020 میں بوائس تھامسن انسٹی ٹیوٹ کے محققین نے ایک مکمل اور مفید ٹماٹر پین جینوم پیدا کرنے کے لیے جنگلی ٹماٹر کے لیے ایک اعلیٰ معیار کا حوالہ جینوم بنایا۔ انہوں نے جینوم کے وہ حصے دریافت کیے جو پھلوں کے ذائقے ، سائز اور پکنے ، تناؤ رواداری اور بیماریوں کے خلاف مزاحمت کو کم کرتے ہیں۔ جزوی طور پر جدید ٹیکنالوجی کا شکریہ جو ڈی این اے کے بہت لمبے ٹکڑوں کو پڑھ سکتی ہے ، حوالہ جینوم موجودہ ڈیٹا بیس سے زیادہ مکمل اور درست ہے۔
پرانی ترتیب کی ٹیکنالوجیز جو ڈی این اے کے چھوٹے ٹکڑوں کو پڑھتی ہیں سنگل بیس لیول پر تغیرات کی نشاندہی کرتی ہیں۔ تاہم ، وہ ساختی مختلف حالتوں کو تلاش کرنے میں اچھے نہیں ہیں جیسے ڈی این اے کے بڑے حصوں کے اندراج ، حذف ، الٹی یا نقل۔
2019 میں ، محققین کے ایک بین الاقوامی گروپ نے 725 فائیلوجنیٹک اور جغرافیائی طور پر نمائندہ اقسام کے جینوم تسلسل کا استعمال کرتے ہوئے ٹماٹر پین جینوم بنایا۔ اس ڈیٹا بیس میں 4,873،XNUMX جین شامل ہیں جو اصل حوالہ جینوم میں نہیں پائے جاتے ہیں۔ موجودہ/غیر حاضر تغیرات کے تجزیوں سے ٹماٹر کے پالنے اور بہتری کے دوران جین کی کافی کمی اور جینوں اور پروموٹرز کے شدید منفی انتخاب کا انکشاف ہوا۔
مکمل مضمون www.seedworld.com پر پڑھیں۔